Wat te zoeken in een platform voor monsterbeheer

In biologische en chemische R&D-laboratoria kan "monsterbeheer" veel verschillende dingen betekenen.

Een "monster" kan een levende muis in een grote kolonie zijn. 

Of een cellijn in een cryobuis die aan zijn 20e passage toe is. 

Of een nieuw gesynthetiseerde chemische stof. 

Of een recent geconstrueerde plasmide.

"Beheer" is net zo dubbelzinnig: het kan verwijzen naar wat voor soort biospecimen of chemische stof een monster is, waar het is opgeslagen, wie het het laatst heeft gebruikt en wanneer, of hoeveel ervan is opgeslagen. Om al deze monsterinformatie samen met het monster zelf te beheren, moeten laboratoria zorgvuldig plannen en aandacht besteden aan deze details.

Gelukkig zijn hier softwareoplossingen voor. Van oudsher gebruikten wetenschappers LIMS-systemen (Laboratory Inventory Management Systems) voor efficiënt en effectief monsterbeheer, maar meer recent vertrouwen wetenschappers op DSM-platforms (Digital Sample Management Software). 

Er zijn enkele subtiele verschillen tussen een LIMS, DSM-platform en vele andere, maar hoe je het ook noemt (in de volgende blog gebruiken we LIMS), er zijn belangrijke functies voor monsterbeheer die alle laboratoria nodig hebben om succesvol te zijn. 

In deze blog heb ik 5 essentiële kenmerken voor elk digitaal platform voor monsterbeheer uitgelicht.

Traceerbaarheid van monsters

Het traceren van monsters is essentieel om de exacte locatie van een monster in het lab te vinden en waar het is opgeslagen. Dit is vooral belangrijk wanneer meerdere onderzoekers en technici vertrouwen op of regelmatig gebruik maken van dezelfde monsters.

Controlespoor

Een controletraject biedt een chronologisch overzicht van alle activiteiten met betrekking tot het verzamelen, hanteren, opslaan, analyseren en afvoeren van monsters. Zie het als een historisch verslag van het wie, wat, wanneer (tot op datum en tijd), waar, waarom en hoe van een monster.

Controlesporen zijn essentieel om de integriteit en traceerbaarheid van een monster te garanderen. Het kan gebruikt worden om afwijkingen van standaard werkprocedures of mogelijke fouten in de monsterbehandeling te identificeren en om wijzigingen in het monster of de bijbehorende gegevens vast te leggen.

Voorbeeld updates

Net zoals wij onze sociale media updaten, krijgen monsters statusupdates. Een voorbeeld hiervan is wanneer je iets met het monster doet (bijvoorbeeld controleren op contaminatie en nu het monster updaten naar "contaminatie: geslaagd"). Omdat dit zo'n vaak uitgevoerde activiteit is, moet elk LIMS snelle en eenvoudige functies ondersteunen om dit te doen. 

Specifieke capaciteiten voor biologie of chemie

Er zijn LIMS die eenvoudige of op lijsten gebaseerde platforms voor gegevensbeheer zijn. Maar wat gebeurt er als je gespecialiseerde gegevens moet opslaan, zoals SMILES (simplified molecular-input line-entry system) chemische notatiestrings of moet integreren met andere digitale platforms, zoals het renderen van een plasmide uit GenBank?

Veel laboratoria maken de fout om 4 of 5 softwareplatforms te kopen om aan die behoeften te voldoen, zonder zich te realiseren dat er uitgebreide oplossingen zijn die een verscheidenheid aan noodzakelijke taken voor monsterbeheer combineren. 

Bekijk ons artikel, "Het digitale lab: op zoek naar slankere, groenere activiteiten" in Natuur die hier meer over vertelt. 

Sample Lineage

Of u nu chemische derivaten of de ouder-kind relatie van uw biospecimens volgt, zorg ervoor dat uw systeem monsterlijnen en relaties tussen monsters in uw collectie kan volgen. Deze functie is vooral belangrijk als u betrokken bent bij biobanking. Functies zoals deze kunnen soms over het hoofd worden gezien of worden verondersteld deel uit te maken van LIMS. 

Vind de beste manier om je monsters te beheren

De beste softwareplatforms hebben alle functies in het systeem ingebouwd. Als een softwareplatform niet in staat is om deze mogelijkheden te combineren in een gebruiksvriendelijke, aanpasbare interface of meer werk voor je creëert, dan is het misschien niet de meest efficiënte of effectieve oplossing voor je monsterbeheer.

Laten we praten over digitale transformatie, AI en de wereld van biotech! Neem hier contact met ons op.