Waarom de overstap naar een elektronisch labnotitieboek (ELN) een goed idee is

Genomics, proteomics en andere 'omics'-technologieën hebben levenswetenschappers in de academische wereld, de industrie en bij de overheid bergen gegevens en ongekende inzichten opgeleverd. Hoewel deze "big data"-technieken krachtig zijn, hebben ze een aantal verouderde infrastructuren onder druk gezet, namelijk het papieren notitieboekje voor het vastleggen, opslaan, analyseren en verspreiden van informatie in een laboratoriumomgeving.

Neem genomicamethodendie bijvoorbeeld 10^21 bases per jaar in sequencinggegevens en ongeveer 2 tot 40 EB (dat is een exabyte; 1 quintiljoen of 10^18 bytes) per jaar die opgeslagen moeten worden. Deze schaal is meer dan astronomisch: als elke byte een centimeter lang zou zijn, zou deze zich meer dan 1 miljard keer uitstrekken naar de maan en terug naar de aarde. Als je daar de digitale beeldgegevens en andere gegevensintensieve technieken bij optelt, moet de massa gegevens veilig, beveiligd, gemakkelijk toegankelijk en deelbaar zijn (zoals aanbevolen door goede wetenschappelijke praktijken en verplicht gesteld door veel financieringsinstanties) wordt overweldigend. 

De successen en tekortkomingen van papieren labnotitieboeken

Ondanks de grote afhankelijkheid van digitale gegevens, is het papieren labschrift de kern voor gegevens, metadata, gegevensanalyse, protocollen en monsters. De afhankelijkheid van papier is een belangrijke belemmering voor wetenschappelijke vooruitgang. Papier en digitale gegevens integreren niet naadloos. Veel onderzoekers worden gedwongen tot een hybride bestaan dat leidt tot gegevensverlies, problemen met repliceerbaarheid en reproduceerbaarheid, niet-naleving van mandaten voor het delen van gegevens, en nog veel meer. De NIH rapporteerde zelfs dat problemen met niet-reproduceerbaarheid voortkomen uit een gebrek aan geschikte documentatiemethodenVeel daarvan zijn verbonden met het gebruik van een papieren labschrift.

Waarom zijn papieren labnotitieboeken er nog?

Elektronische laboratoriumnotitieboeken (ELN's)die een softwareoplossing kunnen bieden voor het maken van notities, gegevensopslag en het organiseren van informatie, bieden ongelooflijke voordelen ten opzichte van papieren labnotitieboeken. 

Toch genieten veel onderzoekers van de vrijheid van het met de hand tekenen van workflows of chemische structuren, wat kan worden gedaan terwijl persoonlijke beschermingsmiddelen (PPE) worden gedragen. Het is ook nodig om een nieuw softwareprogramma lerendie soms ingewikkeld kunnen zijn, vooral wanneer ze niet intuïtief te gebruiken zijn en er onvoldoende rekening is gehouden met de gebruikerservaring. Uiteindelijk leidt dit tot een lage stimulans om hun informatiebeheerpraktijken te veranderen of nieuwe in te voeren.

3 Voordelen van een elektronisch labnotitieboek (ELN)

Geen twijfel mogelijk: Het is moeilijk om vastgeroeste gewoontes te veranderen - zelfs die gewoontes die inefficiëntie en gegevensverlies veroorzaken.

De huidige uitdagingen op het gebied van gegevensbeheer waar veel laboratoria mee te maken hebben, staan de wetenschappelijke vooruitgang die mogelijk wordt gemaakt door big data echter in de weg. 

ELN's bieden de mogelijkheid om de status-quo te verbeteren door het verwijderen van vergankelijke papieren notitieblokken en onveilige opslagsystemen.

Reden om een ELN te gebruiken #1: Reproduceerbaarheid bevorderen

Reproduceerbaarheid is altijd een belangrijk onderwerp geweest in de wetenschap. Toch neemt de complexiteit van gegevensverzameling en berekeningen toe door de toenemende afhankelijkheid van big data, bioinformatica-analyse en vele softwaretools. Daarmee groeit ook het potentieel voor problemen met reproduceerbaarheid neemt toe. 

ELN's bieden een pad naar betere documentatie van onderzoeksworkflows, het bijhouden van revisies en gegevensbeheer, waardoor andere onderzoekers experimenten in de toekomst kunnen herhalen, gegevensverlies wordt voorkomen en een efficiënt beoordelingsproces voor alle gegevens mogelijk wordt.

Reden om een ELN te gebruiken #2: Verbeterde toegankelijkheid

Heb je wel eens geprobeerd om terug te bladeren in je oude experimenten of die van iemand anders om een belangrijk protocol of dataset te vinden? Papieren labnotitieboeken maken het erg moeilijk om historische gegevens terug te vinden. Het kan tijdrovend zijn om oudere aantekeningen uit te kammen, zelfs als er door de gebruiker samengestelde indexen of een inhoudsopgave is. 

Het voordeel van een ELN is dat een gebruiker snel protocollen, items, monsters of datasets kan doorzoeken met eenvoudige trefwoordqueries, tijdbereiken, metadatatags of gebruikers. Dit maakt het ook gemakkelijk om items opnieuw te ordenen en sorteren, terwijl je met een papieren labnotitieblok vastzit aan een chronologische volgorde. 

Reden #3: Directe deelbaarheid

Samenwerking en partnerschap maken deel uit van de wetenschap; of je nu samenwerkt met iemand in dezelfde regio of internationaal, het delen van belangrijke informatie is noodzakelijk. Met papieren labnotitieboeken is het delen van informatie met je collega's een tijdrovend proces waarbij je de van toepassing zijnde aantekeningen moet opzoeken en scannen.

ELN's bieden een aantrekkelijk alternatief en brengen Google Doc-achtig gemak voor het delen van informatie. Rechten voor bekijken/bewerken kunnen onmiddellijk worden toegekend aan items, protocollen en datasets, ongeacht de geografische locatie. 

Omarm de voordelen van elektronische laboratoriumnotitieboeken

ELN's bieden nog veel meer voordelen die laboratoriumactiviteiten kunnen transformeren en de productiviteit kunnen verhogen. 

Downloaden "Breng 'alles digitaal' naar uw lab". whitepaper om meer te leren:

• Nadelen van het gebruik van een hybride informatiebeheersysteem in de biowetenschappen
• Waarom je door nu "helemaal digitaal" te gaan op de lange termijn tijd en geld bespaart
• Meer voordelen van het gebruik van een ELN voor het opslaan en bijhouden van uw biowetenschappelijke gegevens
• Hoe eLabJournal kan je problemen met papieren labnotitieboekjes oplossen
• Waarom Deka Biosciences eLabJournal gebruikt