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Por qué es una buena idea pasarse al cuaderno electrónico de laboratorio (ELN)

Por eLabNext 3 min leer 09 feb 2023

La genómica, la proteómica y otras tecnologías "ómicas" han proporcionado montañas de datos y conocimientos sin precedentes a los científicos de los ámbitos académico, industrial y gubernamental. Aunque potentes, estas técnicas de "big data" han puesto a prueba algunas infraestructuras obsoletas, como el cuaderno de laboratorio de papel, para registrar, almacenar, analizar y distribuir información en un laboratorio.

Toma métodos genómicosque generan 10^21 bases al año en datos de secuenciación y aproximadamente de 2 a 40 EB (eso es un exabyte; 1 quintillón o 10^18 bytes) al año que hay que almacenar. Esta escala va más allá de lo astronómico: si cada byte midiera una pulgada, se extendería hasta la Luna y de vuelta a la Tierra más de mil millones de veces. Si a esto se añaden los datos de imágenes digitales y otras técnicas de gran cantidad de datos, la masa de datos tiene que estar segura, protegida, ser fácilmente accesible y poder compartirse (como recomiendan las buenas prácticas científicas y ordena el muchos organismos de financiación) se vuelve abrumadora. 

Éxitos y fracasos de los cuadernos de laboratorio de papel

A pesar de la gran dependencia de los datos digitales, el núcleo de los datos, metadatos, análisis de datos, protocolos y muestras es el cuaderno de laboratorio de papel. La dependencia del papel es un obstáculo importante para el progreso científico. El papel y los datos digitales no se integran a la perfección. Muchos investigadores se ven obligados a una existencia híbrida que conduce a la pérdida de datos, problemas de replicabilidad y reproducibilidad, incumplimiento de los mandatos de intercambio de datos, y mucho más. De hecho, los NIH informaron de que los problemas de no reproducibilidad se derivan de una falta de métodos de documentación adecuadosmuchas de las cuales están asociadas al uso de un cuaderno de laboratorio de papel.

¿Por qué siguen existiendo los cuadernos de laboratorio de papel?

Cuadernos electrónicos de laboratorio (ELN)que pueden ofrecer una solución de software para la toma de notas, el almacenamiento de datos y la organización de la información, proporcionan increíbles ventajas frente a los cuadernos de laboratorio de papel. 

Sin embargo, muchos investigadores disfrutan de la libertad de dibujar a mano flujos de trabajo o estructuras químicas, que puede realizarse con el equipo de protección individual (EPI) puesto. También es necesario aprender un nuevo programa informáticoque a veces puede resultar complicado, sobre todo cuando su uso no es intuitivo y no se ha tenido debidamente en cuenta la experiencia del usuario. En última instancia, esto conduce a un bajo incentivo para cambiar sus prácticas de gestión de la información o adoptar otras nuevas.

3 Ventajas del cuaderno electrónico de laboratorio (ELN)

No cabe duda: Cambiar hábitos arraigados -incluso los que generan ineficacia y pérdida de datos- es difícil.

Sin embargo, los actuales problemas de gestión de datos a los que se enfrentan muchos laboratorios se interponen en el camino de los avances científicos que permiten los macrodatos. 

Las ELN ofrecen la oportunidad de mejorar el statu quo, eliminando los impermanentes cuadernos de papel y los inseguros sistemas de almacenamiento.

Razones para utilizar una ELN #1: Promover la reproducibilidad

Reproducibilidad siempre ha sido un problema importante en la ciencia. Sin embargo, la recopilación de datos y la complejidad computacional están creciendo con la creciente dependencia de los macrodatos, el análisis bioinformático y muchas herramientas de software. Con ello, el potencial de problemas de reproducibilidad aumenta. 

Las ELN ofrecen una vía hacia una mejor documentación de los flujos de trabajo de investigación, seguimiento de revisiones y gestión de datos, ayudando a otros investigadores a repetir experimentos en el futuro, evitando la pérdida de datos y permitiendo un proceso de revisión eficiente para todos los datos.

Razón para utilizar una ELN #2: Mejor accesibilidad

¿Alguna vez ha intentado buscar en sus antiguos experimentos o en los de otra persona un protocolo o conjunto de datos importante? Los cuadernos de laboratorio en papel dificultan enormemente la localización de registros históricos. Puede llevar mucho tiempo rastrear las entradas más antiguas, incluso si hay índices construidos por el usuario o una tabla de contenidos. 

La ventaja de una ELN es que el usuario puede buscar rápidamente protocolos, entradas, muestras o conjuntos de datos mediante simples consultas de palabras clave, intervalos de tiempo, etiquetas de metadatos o usuarios. Esto también facilita la reordenación y clasificación de las entradas, mientras que, con un cuaderno de laboratorio de papel, uno se ve atrapado en el orden cronológico. 

Razón #3: Compartibilidad instantánea

La colaboración y la asociación forman parte de la ciencia; tanto si se trabaja con alguien en la misma bahía como a escala internacional, es necesario compartir información crítica. Con los cuadernos de laboratorio en papel, compartir información con tus colegas es un proceso que requiere mucho tiempo y que implica localizar y escanear las entradas correspondientes.

Las redes electrónicas ofrecen una alternativa atractiva, ya que permiten compartir información con la facilidad de Google Doc. Los permisos de visualización y edición pueden concederse instantáneamente a entradas, protocolos y conjuntos de datos, independientemente de la ubicación geográfica. 

Aproveche las ventajas de los cuadernos electrónicos de laboratorio

Las ELN ofrecen muchas otras ventajas que pueden transformar las operaciones de laboratorio y aumentar la productividad. 

Descargar el "Todo digital en su laboratorio". whitepaper para aprender:

  • Inconvenientes de la utilización de un sistema híbrido de gestión de la información en las ciencias de la vida
  • Por qué digitalizar ahora le ahorrará tiempo y dinero a largo plazo
  • Más ventajas de utilizar una ELN para almacenar y rastrear sus datos de ciencias de la vida
  • Cómo eLabJournal puede resolver sus problemas de cuadernos de laboratorio de papel
  • Por qué Deka Biosciences utiliza eLabJournal 

Libro Blanco: Lleve lo digital a su laboratorio

Más información sobre la transición de su laboratorio de un cuaderno de laboratorio de papel a una ELN

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