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Por que a transição para um caderno de laboratório eletrônico (ELN) é uma ótima ideia

Por eLabNext 3 min de leitura 09 de fevereiro de 2023

As tecnologias genômicas, proteômicas e outras tecnologias 'ômicas' forneceram montanhas de dados e percepções sem precedentes para cientistas da vida na academia, no setor e no governo. Embora sejam poderosas, essas técnicas de "big data" sobrecarregaram algumas infraestruturas ultrapassadas, como o caderno de laboratório de papel, para registrar, armazenar, analisar e distribuir informações em um ambiente de laboratório.

Pegue métodos genômicospor exemplo, que geram 10^21 bases por ano em dados de sequenciamento e aproximadamente 2 a 40 EB (isso é um exabyte; 1 quintilhão ou 10^18 bytes) por ano que precisam ser armazenados. Essa escala é mais do que astronômica: se cada byte tivesse uma polegada de comprimento, ele se estenderia até a Lua e voltaria à Terra mais de 1 bilhão de vezes. Se adicionarmos a isso os dados de imagens digitais e outras técnicas com grande volume de dados, a massa de dados precisa ser segura, protegida, facilmente acessível e compartilhável (conforme recomendado pelas boas práticas científicas e exigido pela muitas agências de financiamento) se torna esmagadora. 

Os sucessos e as deficiências dos cadernos de laboratório de papel

Apesar da grande dependência de dados digitais, o núcleo de dados, metadados, análise de dados, protocolos e amostras é o caderno de laboratório em papel. A dependência do papel é uma barreira significativa para o progresso científico. Os dados digitais e em papel não se integram perfeitamente. Muitos pesquisadores são forçados a uma existência híbrida que leva à perda de dados, a problemas de replicabilidade e reprodutibilidade, à não conformidade com as exigências de compartilhamento de dados e muito mais. De fato, o NIH relatou que os problemas de não reprodutibilidade decorrem de uma falta de métodos de documentação adequadosMuitos deles estão associados ao uso de um caderno de laboratório de papel.

Então, por que os cadernos de laboratório de papel ainda existem?

Cadernos eletrônicos de laboratório (ELNs)Os notebooks de laboratório, que podem oferecer uma solução de software para fazer anotações, armazenar dados e organizar informações, oferecem vantagens incríveis em relação aos notebooks de papel. 

No entanto, muitos pesquisadores desfrutam da liberdade de fluxos de trabalho de desenho à mão ou estruturas químicas, que pode ser feito com o uso de equipamento de proteção individual (EPI). Há também a necessidade de aprender um novo programa de softwareque às vezes pode ser complicado, principalmente quando não é intuitivo e a experiência do usuário não foi considerada adequadamente. Em última análise, isso leva a um baixo incentivo para mudar suas práticas de gerenciamento de informações ou adotar novas práticas.

3 Vantagens de um Electronic Lab Notebook (ELN)

Não há dúvidas quanto a isso: Mudar hábitos arraigados - mesmo aqueles que geram ineficiências e perda de dados - é difícil.

No entanto, os desafios atuais de gerenciamento de dados que muitos laboratórios enfrentam estão impedindo os avanços científicos possibilitados pelo Big Data. 

As ELNs oferecem uma oportunidade de melhorar o status quo, eliminando cadernos de papel impermanentes e sistemas de armazenamento inseguros.

Razão para usar um ELN #1: Promoção da reprodutibilidade

Reprodutibilidade sempre foi um problema importante na ciência. No entanto, a complexidade da coleta de dados e da computação está aumentando com a crescente dependência de big data, análise de bioinformática e muitas ferramentas de software. Com isso, a possibilidade de mais problemas com a reprodutibilidade aumentos. 

As ELNs oferecem um caminho para uma melhor documentação dos fluxos de trabalho de pesquisa, rastreamento de revisões e gerenciamento de dados, ajudando outros pesquisadores a repetir experimentos no futuro, evitando a perda de dados e permitindo um processo de revisão eficiente para todos os dados.

Razão para usar uma ELN #2: Acessibilidade aprimorada

Já tentou folhear seus experimentos antigos ou os de outra pessoa para encontrar um protocolo ou conjunto de dados importantes? Os cadernos de laboratório em papel são notoriamente difíceis de localizar registros históricos. Pode ser demorado vasculhar as entradas mais antigas, mesmo que haja índices construídos pelo usuário ou um índice. 

A vantagem de um ELN é que o usuário pode pesquisar rapidamente protocolos, entradas, amostras ou conjuntos de dados usando consultas simples de palavras-chave, intervalos de tempo, tags de metadados ou usuários. Isso também facilita a reordenação e a classificação das entradas, ao passo que, com um caderno de laboratório em papel, você fica preso à ordem cronológica. 

Motivo #3: possibilidade de compartilhamento instantâneo

A colaboração e a parceria fazem parte da ciência; seja trabalhando com alguém na mesma baía ou internacionalmente, o compartilhamento de informações críticas é necessário. Com cadernos de laboratório em papel, o compartilhamento de informações com seus colegas é um processo demorado que envolve a localização e a digitalização das entradas aplicáveis.

As ELNs oferecem uma alternativa atraente, trazendo uma facilidade semelhante à do Google Doc para o compartilhamento de informações. As permissões de visualização/edição podem ser concedidas instantaneamente a registros, protocolos e conjuntos de dados, independentemente da localização geográfica. 

Aproveite as vantagens dos cadernos de laboratório eletrônicos

As ELNs oferecem muitos outros benefícios que podem transformar as operações do laboratório e aumentar a produtividade. 

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  • Desvantagens do uso de um sistema híbrido de gerenciamento de informações nas ciências da vida
  • Por que adotar "tudo digital" agora economizará tempo e dinheiro a longo prazo
  • Mais benefícios de usar uma ELN para armazenar e rastrear seus dados de ciências biológicas
  • Como eLabJournal pode resolver seus problemas de caderno de laboratório de papel
  • Por que a Deka Biosciences usa o eLabJournal 

Whitepaper: Trazendo "tudo digital" para seu laboratório

Saiba mais sobre a transição de seu laboratório de um caderno de papel para um ELN

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