eLabJournal permet une gestion étendue de grands volumes de données de patients horodatées pour la MOL

Notre laboratoire a créé une biobanque pour plus de 40 sous-types de sarcomes. Nous avions besoin d'un meilleur moyen de suivre notre inventaire d'échantillons biologiques. eLab nous a permis de stocker des informations cliniques sur la même plateforme que celle où l'inventaire d'échantillons biologiques a été enregistré.

Nous avions l'habitude d'utiliser des feuilles de calcul Excel séparées pour suivre l'inventaire et les informations cliniques, ce qui était fastidieux et prenait beaucoup de temps. eLab a fourni une plateforme sécurisée capable de se développer et de s'adapter à notre biobanque en constante évolution.

- Tanya Heim, Coordinateur de la recherche clinique

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Université de Pittsburgh 

Les Laboratoire d'oncologie musculo-squelettique (MOL) à l'université de Pittsburgh étudie la biologie des tumeurs musculo-squelettiques primaires et métastatiques. Ils contribuent à la mise au point de traitements pour les personnes atteintes de sarcomes métastatiques et de métastases osseuses du cancer du sein, en particulier pour les patients de l'UPMC.

En 2010, MOL a créé un registre des tumeurs oncologiques musculo-squelettiques et une banque de tissus. Des années de données cliniques et d'échantillons de tissus horodatés, collectés tout au long de l'évolution de la maladie et du traitement, fournissent désormais des preuves de la progression de la maladie et des effets du traitement.

Le nombre important de patients et la variété des manifestations pathologiques traitées à l'UPMC Hillman Cancer Institute, combinés à l'infrastructure de recherche de l'Université de Pittsburgh, font de la bibliothèque une ressource unique pour la recherche translationnelle. Les données cliniques des patients et les échantillons de tissus constituent une ressource de recherche puissante qu'il n'est pas possible d'obtenir ailleurs.

Objectif

La mission du MOL est de mieux comprendre la biologie des tumeurs musculo-squelettiques primaires et métastatiques. Le MOL étudie de nouvelles approches pharmacologiques et moléculaires pour cibler les sarcomes métastatiques et les métastases osseuses du cancer du sein. Son objectif principal est de maintenir un programme de recherche vigoureux et complet en oncologie musculo-squelettique à l'université de Pittsburgh, dans le but de traduire les découvertes en solutions cliniques pour les patients.

Défi

Nécessité de suivre ensemble les informations cliniques et les échantillons

Notre laboratoire a créé une biobanque pour plus de 40 sous-types de sarcomes. Nous avions besoin d'un meilleur moyen de suivre notre inventaire d'échantillons biologiques et de les relier aux données cliniques associées à chaque patient.

Solution

Suivi sûr, fiable et synchronisé des données cliniques des patients et des échantillons biologiques dans les biobanques

Le MOL s'est entretenu avec de nombreux éditeurs de logiciels d'inventaire de laboratoire, mais aucun ne répondait aussi bien à ses besoins que le système eLabJournal de Bio-ITech, qui contient à la fois le module eLabInventory et le module Electronic Lab Notebook (cahier de laboratoire électronique). Les autres systèmes n'étaient pas aussi personnalisables qu'eLabJournal et certains n'offraient pas d'hébergement dans le nuage, ce qui était essentiel pour leur laboratoire, surtout aujourd'hui (depuis COVID-19). Ils ont décidé d'installer eLabJournal dans leur laboratoire d'oncologie musculo-squelettique (MOL) à l'université de Pittsburgh.

Ils collectent des échantillons biologiques et des données cliniques auprès de patients chez qui un sarcome a été diagnostiqué au centre médical de l'université (UMC). eLabJournal les aide à stocker et à suivre leur inventaire d'échantillons biologiques et toutes les données cliniques associées dans une application unique et transparente. Pour l'instant, ils s'appuient principalement sur la partie inventaire, mais ils intègrent peu à peu le suivi des expériences lorsque les membres utilisent des spécimens dans la biobanque.

Résultat

eLabJournal relie les échantillons biologiques et les données pour un fonctionnement totalement fiable des biobanques

Le MOL dispose déjà de la biobanque de sarcomes la plus diversifiée du pays. Maintenant, eLabJournal les aide à partager rapidement les échantillons biologiques et les données avec les membres de leur laboratoire et d'autres collaborateurs. Ils sont convaincus qu'ils peuvent suivre tous leurs échantillons biologiques de manière efficace. Le module eLabInventory d'eLabJournal permet non seulement de savoir en un instant où se trouvent les échantillons, mais aussi de les relier sans équivoque aux données cliniques - ce qui s'est passé avec le patient et le traitement. Ils commencent même à intégrer le suivi de nouvelles expériences lorsque les membres utilisent les échantillons biologiques existants dans leurs études de recherche, grâce au module de carnet de laboratoire électronique d'eLabJournal.