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eLabNext améliore considérablement la gestion des données et l'inventaire des échantillons de Diel Lab

4 min lire 12 Déc 2023

L'utilisation d'eLabJournal a considérablement amélioré la capacité de mon laboratoire à gérer les expériences individuelles liées à chaque projet mené dans le laboratoire. En outre, la gestion et la traçabilité des données se sont considérablement améliorées depuis que nous avons adopté la plateforme eLabNext.

Diego Diel, DVM, M.S., Ph.D., professeur agrégé de virologie au département de médecine des populations et des sciences diagnostiques du Collège de médecine vétérinaire de l'Université Cornell.

Le laboratoire Diel au Collège de médecine vétérinaire de l'Université Cornell

Établi en 2014, le Laboratoire Diel est dirigé par Diego Diel, DVM, M.S., Ph.D., et se concentre sur la compréhension des mécanismes moléculaires qui sous-tendent l'infection, l'immunité et la pathogenèse des virus à ADN et à ARN chez l'hôte. L'objectif à long terme du laboratoire est d'utiliser cette recherche fondamentale pour développer de nouveaux vaccins et de nouvelles plates-formes vaccinales pour l'homme et l'animal. Le laboratoire se concentre également sur le développement de diagnostics de nouvelle génération pour la détection, l'identification et la caractérisation des virus.

Entre 2014 et 2019, le laboratoire Diel a fonctionné dans le cadre du département des sciences vétérinaires et biomédicales et des laboratoires de recherche Oscar E. Olson de l'université d'État du Dakota du Sud. En 2019, le Diel Lab a déménagé au département de médecine des populations et des sciences diagnostiques du Collège de médecine vétérinaire de l'Université Cornell, où il opère actuellement. Il emploie une équipe talentueuse de 10 scientifiques et doctorants possédant une vaste expertise en virologie fondamentale et moléculaire. 

Actuellement, le laboratoire Diel étudie comment les picornavirus et les coronavirus (y compris le SARS-CoV-2) échappent à la détection par le système immunitaire inné. Pendant la pandémie de COVID-19, le laboratoire a commencé à étudier la large gamme d'hôtes du virus SARS-CoV-2 et a découvert que le virus infecte cerf de Virginie ainsi que tigres et lions hébergés au zoo du Bronx et qui peuvent servir de réservoirs pour les variantes préoccupantes. Enfin, le laboratoire étudie les effets des changements génétiques sur la pathogenèse virale, la dynamique de l'infection et le tropisme tissulaire. 

Objectifs

Court terme: À court terme, le laboratoire Diel cherche à mieux comprendre les mécanismes moléculaires qui sous-tendent l'infection, l'immunité et la pathogenèse des virus à ADN et à ARN chez l'hôte.

A long terme : L'objectif à long terme du laboratoire Diel est de développer de nouveaux vaccins et de nouvelles plates-formes vaccinales pour l'homme et l'animal. Il se concentre également sur le développement de diagnostics de nouvelle génération pour la détection, l'identification et la caractérisation des virus.

Défis 

Mieux inventorier les échantillons et les réactifs

La gestion et l'organisation claires et précises des stocks dans un laboratoire d'étudiants et de scientifiques constituent un défi. En particulier, la coordination du suivi et du réapprovisionnement des échantillons et des réactifs nécessite un processus solide pour éviter les pénuries de réactifs ou leur expiration, ainsi que la perte ou l'égarement d'échantillons. Une communication efficace, le respect et la formation à l'établissement de protocoles d'inventaire sont essentiels au maintien de l'intégrité et de l'efficacité des recherches et expériences en cours.

Documenter de manière précise et cohérente les expériences, les enregistrements et les données. 

La documentation précise et cohérente des expériences, des enregistrements et des données dans un laboratoire de virologie avec une grande équipe peut être problématique lorsqu'il y a des variations dans les pratiques de documentation et l'interprétation des données. Il est essentiel de maintenir des modes opératoires normalisés uniformes pour l'enregistrement, le stockage et l'analyse des données afin de garantir la cohérence et d'éviter les erreurs ou les incohérences. Une formation régulière et des mesures de contrôle de la qualité sont essentielles pour atténuer ces difficultés et préserver l'intégrité des résultats de la recherche.

Le laboratoire Diel était à la recherche d'une solution facile à utiliser et rentable qui pourrait être mise en œuvre par tous les membres de l'équipe du laboratoire afin de garantir que toutes les données critiques, les échantillons et les réactifs sont gérés de manière à ce que les objectifs à court et à long terme du laboratoire puissent être atteints.

Solution

eLabNext améliore la collaboration et l'organisation des institutions

Pour relever ces défis, le laboratoire Diel a cherché des options de numérisation des laboratoires en ligne et a trouvé le site web eLabNext. La plateforme eLabNext a d'abord été mise en place dans le laboratoire de virologie de l'Institut de recherche sur les maladies infectieuses de l'Union européenne. Centre de diagnostic de la santé animale de Cornell. Après une mise en œuvre réussie, le logiciel a été transféré au laboratoire Diel. 

Plus précisément, le laboratoire a utilisé eLabInventory pour établir des flux de travail de suivi des stocks, des échantillons et des spécimens. Le logiciel de gestion des stocks du laboratoire s'intègre à eLabJournal, qui a également été mis en œuvre par le laboratoire Diel en tant que cahier de laboratoire électronique tout-en-un, supprimant ainsi la dépendance du laboratoire à l'égard des cahiers de laboratoire en papier et le temps associé à la recherche manuelle des données et des enregistrements expérimentaux. Sans le logiciel eLabNext, le laboratoire Diel aurait pu jeter par inadvertance des échantillons critiques et gérer les données de manière inappropriée, ce qui aurait entraîné leur perte. 

Le laboratoire Diel étant impliqué dans des collaborations internes et externes, l'utilisation de la plateforme eLabNext présente l'avantage supplémentaire de faciliter le partage des données et des détails expérimentaux entre plusieurs utilisateurs. Cela permet au laboratoire de s'engager efficacement dans des collaborations et des partenariats multi-institutionnels avec des canaux de communication ouverts et un partage des données.

En outre, eLabNext aide à gérer les organisations de projets multiples en classant les expériences et les entrées dans des dossiers distincts. Cette structuration améliorée permet des opérations de laboratoire plus efficaces et plus productives. 

Résultats

eLabNext permet un inventaire des échantillons et une gestion des données plus précis

Un an plus tard, la plateforme eLabNext fait partie du quotidien du laboratoire Diel. Il a fallu du temps pour dresser un inventaire complet des données, des réactifs et des échantillons du laboratoire et les importer dans le logiciel. L'effort en valait la peine. Aujourd'hui, le laboratoire bénéficie d'opérations plus efficaces grâce à un inventaire plus précis des échantillons et à une meilleure traçabilité des réactifs, des expériences, des modes opératoires normalisés et des données générées par chaque expérience.

La mise en œuvre d'une plate-forme logicielle spécialisée a considérablement amélioré l'efficacité de nos processus de stockage et de récupération des échantillons. Ce logiciel fournit un système centralisé et numérisé qui catalogue et suit méticuleusement chaque échantillon, rationalisant ainsi l'organisation de notre vaste inventaire d'échantillons. Il a permis de réduire considérablement le temps et les efforts consacrés auparavant à la tenue manuelle des dossiers et à la recherche dans les archives physiques. En outre, les fonctions de recherche et d'extraction robustes de la plateforme ont permis au laboratoire Diel de localiser l'emplacement exact des échantillons en quelques secondes, garantissant un accès plus rapide pour les expériences et la recherche et améliorant en fin de compte la productivité globale et la précision du laboratoire dans la gestion des échantillons.

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