L'ELN est l'acteur principal de la numérisation des laboratoires".

Les systèmes logiciels tels que LIMS (système de gestion des informations de laboratoire) et ELN (journal électronique de laboratoire) permettent de numériser les laboratoires. La tendance est à la hausse dans les laboratoires, déclare Margriet Mestemaker d'eLabNext, en s'appuyant sur les tendances et les actualités les plus récentes en matière d'intégration des données, de fiabilité des données et d'intelligence artificielle, c'est-à-dire d'intelligence artificielle.

Les exigences en matière de numérisation des laboratoires sont de plus en plus élevées et les systèmes logiciels de plus en plus fonctionnels, explique Margriet Mestemaker, accountmanager Benelux chez eLabNext. Le LIMS et l'ELN sont deux éléments essentiels de la numérisation, mais ils se différencient nettement. "Un système de gestion de l'information en laboratoire est un véritable 'outil', conçu pour un processus de laboratoire amélioré, doté de nombreuses fonctionnalités et d'une grande flexibilité. Un laboratoire électronique offre à peine plus de flexibilité et de possibilités de couplage avec d'autres systèmes, afin de personnaliser l'outil de travail. C'est pour moi la clé de voûte de la numérisation des laboratoires".

Laboratoire sans papier

Le "laboratoire sans papier" n'est pas non plus un vain mot, selon M. Mestemaker. "Tout le monde utilise un smartphone et profite des outils numériques. Le secteur des laboratoires s'appuie davantage sur la structure et la routine et n'est donc pas en mesure de s'accrocher au papier. Les laboratoires qui n'utilisent que du papier ne me plaisent pas beaucoup plus, mais les grands systèmes d'automatisation sont en fait très inefficaces. Il ne s'agit plus de trouver un endroit central où l'on peut organiser numériquement l'ensemble du flux de travail du laboratoire. Le laboratoire sera donc un lieu où tout se tient, de l'inventaire à la communication des résultats en passant par la planification des analyses et le traitement des données, sans oublier le contrôle de la qualité.

"Le secteur de l'agriculture n'est pas prêt d'être suspendu au papier.

Margriet Mestemaker de eLabNext

Chevauchement entre LIMS et ELN

La conclusion est que le passage à un système ELN ou LIMS n'est qu'une question de temps : "Il n'est pas possible de dire à propos d'un processus de travail et d'un flux de travail bien définis : 'Nous l'avons déjà fait'. C'est pourquoi il est important de savoir, à l'aide d'un lien ouvert, comment le flux de travail peut être dépassé de manière logique par le nouveau système. Je suis convaincu que, lors d'un essai avec un nouveau système, quelqu'un a constaté que la meilleure façon de travailler n'est pas la plus pratique."

Signature du témoin

Il est naturellement nécessaire d'automatiser un plus grand nombre d'étiquetages, mais la conformité est tout aussi importante : il faut s'assurer que les étiquetages sont conformes aux normes. La traçabilité est ici la clé de voûte des processus, des contrôles de qualité et des procédures d'étiquetage pour la mise au point d'un nouveau médicament. Toutes ces procédures doivent être gelées et mises à jour lors des audits. Il faut pour cela disposer de vastes modèles, de flux de travail structurés et d'un renforcement de l'intégration des données, a déclaré M. Mestemaker. La "signature de témoin" est une méthode numérique qui a beaucoup plus de poids : il s'agit de faire signer un document numérique par un expert ou un technicien, pour qu'il soit conforme à un protocole ou à une expérience, de sorte que les données ne puissent pas être généralisées. "Il s'agit là d'un point essentiel pour tous les aspects du processus de laboratoire. Il améliore encore la rapidité d'utilisation du flux de travail et fait en sorte que le datamassage dure un peu plus longtemps."

LIMS, ELN et gestion des données

Les données sont protégées : la sécurité des données est essentielle dans les laboratoires, selon Mestemaker. C'est pourquoi tous les centres de données pour l'hébergement d'applications web LIMS et ELN dans le nuage (public ou privé) doivent être certifiés pour la sécurité de l'information conformément à la norme ISO 27001. Les utilisateurs peuvent également tout héberger dans leur propre maison, sur leurs propres serveurs, mais cela n'a pas d'importance pour eux. "L'option me semble la plus délicate, car les entreprises ne sont pas les seules à être compétentes en matière de cybersécurité, de sauvegardes et de sécurité, alors que ce n'est pas leur cœur de métier".

"Il s'agit d'un travail de longue haleine, mais il n'y a pas de raison que les jeunes s'y intéressent, car il s'agit d'une pratique quotidienne.

Margriet Mestemaker de eLabNext

AI et big data

La numérisation des données est en constante évolution, et les données sont de plus en plus nombreuses. L'intelligence artificielle (IA) est donc un outil qui permet d'extraire des données volumineuses des informations utiles. Grâce aux résultats des réunions, les corrélations entre les paramètres peuvent être analysées ou les photos de cultures cellulaires peuvent être analysées rapidement. "Il s'agit d'un travail remarquable, mais il n'y a pas plus de dix ans qu'il faut pour que la pratique quotidienne se déroule dans le laboratoire.

Mentions légales labdigitalisering

Le temps presse, estime M. Mestemaker, si l'on veut que le nuage de l'IA devienne une réalité ou que l'automatisation et la numérisation se développent rapidement. "Il ne s'agit pas d'un problème, mais bien d'un frein à un grand conservatisme. Mais si les développeurs obtiennent des résultats fantastiques, le reste ne peut que changer. Il faut donc revoir positivement les flux de travail de son propre laboratoire, étudier les avantages d'une plateforme de laboratoire numérique complète et s'appuyer sur une approche ouverte de la numérisation des laboratoires."

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Plate-forme flexible pour ELN

Le besoin d'automatisation et de traçabilité dans son laboratoire de recherche en biotechnologie a été, en 2010, pour deux chercheurs de Groningue, une aide à la mise en place d'eLabNext. Ils ont commencé avec le logiciel Inventariss et l'ont transformé en une plateforme pour la numérisation des laboratoires : journal de laboratoire électronique, système de suivi des inventaires et des échantillons, gestionnaire de protocoles de laboratoire et eLab Marketplace. La place de marché propose des applications, y compris des applications de base, qui permettent d'utiliser les logiciels d'eLabNext afin d'améliorer encore les fonctionnalités. Grâce à sa souplesse d'utilisation, le logiciel d'eLabNext peut également être utilisé dans le cadre de la R&D en biotechnologie, notamment dans un laboratoire d'analyse chimique. L'entreprise est très active à l'échelle mondiale, compte plus de 250 travailleurs médicaux et fait partie du groupe Eppendorf, fournisseur de matériel de laboratoire.

Hans van Eerden

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