CloneAssist wurde entwickelt, um Molekularbiologen bei der Erweiterung ihrer Arbeitsabläufe durch Sequenzanalysen, Annotation, Nachverfolgung und Berichterstellung zu unterstützen.

eLabNext sucht Nutzer, die daran interessiert sind, Beta-Tester diesen Zusatzes zu werden, um Feedback für Funktionsverbesserungen zu sammeln. Als Betatester erhalten die Nutzer eine verlängerte 1-jährige kostenlose Testversion von CloneAssist. Bei der vollständigen Veröffentlichung wird CloneAssist als kostenpflichtiger Zusatz angeboten werden.

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CloneAssist Top-Funktionen - Überblick

1). Nahtlos integriert mit eLabNext

  • Die Datei wird in einem CloneAssist-Abschnitt gespeichert, und eine Vorschau von CloneAssist wird angezeigt, wenn der Benutzer nicht daran arbeitet.
  • Benutzer können jetzt einen CloneAssist-Abschnitt in einem Experiment erstellen.

2). Visualisierung von Plasmiden

  • Die Datendatei wird nun als Plasmid visualisiert. Dabei werden alle Merkmale, Primer, offenen Leserahmen und Restriktionsenzyme angezeigt, so dass Sie die für Ihre Forschung wichtigsten Teile leicht erkennen können.

3). Gelelektrophorese

  • Durch das Schneiden Ihrer Sequenz mit Restriktionsenzymen erhalten die Nutzer verschiedene Fragmente, die häufig durch Gelelektrophorese überprüft werden.
  • CloneAssist bietet eine Visualisierung der Gelelektrophorese mit verschiedenen Markern.
  • Das Gel kann eine oder mehrere Mehrfachreaktionen in einer Ansicht zeigen.

4). Einfaches Schneiden von Molekülen mit bestimmten Restriktionsenzymen und anschließende Anwendung der Ergebnisse auf neue Moleküle

  • Wenn Sie ein oder mehrere Restriktionsenzyme in Ihr Röhrchen geben, können Sie direkt sehen, wie viele Schnitte das Restriktionsenzym in dem/den Molekül(en) vornehmen wird.
  • Die Ergebnisse zeigen alle Fragmente, die bei der Schnittreaktion entstanden sind.

5). Visualisieren Sie sowohl die linearen als auch die zirkulären Sequenzen

  • Wenn Sie eine Auswahl treffen oder ein Merkmal von Interesse auswählen, werden die Ansichten synchronisiert.

6). Benutzerdefinierte Funktionen hinzufügen

  • Fügen Sie Ihre benutzerdefinierten Merkmale in der Reihenfolge hinzu, indem Sie mit dem Mauszeiger über das Ende Ihrer Auswahl fahren und auf "+ Merkmal" klicken.

7). Arbeiten Sie an mehreren Reaktionen gleichzeitig

  • Zur Durchführung einer Reaktion können mehrere Röhrchen erstellt werden. Sie können gleichzeitig geöffnet oder für eine spätere Verwendung zusammengeklappt werden.

8). Mehrere Import-/Exportoptionen

  • Wenn Sie einen neuen CloneAssist-Abschnitt beginnen, können Sie Daten aus verschiedenen Formaten wie Snapgene (.dna), GenBank (.gb), CloneManager (.cm5) und fasta (.fasta) importieren.
  • Moleküle können als Bild (.png) exportiert werden.

9). Filtern Sie die Elemente nach den Bedürfnissen Ihres Labors

  • Die Visualisierungen sind so gestaltet, dass sie den Bedürfnissen der Benutzer entsprechen. Zum Beispiel: Wenn der Benutzer nur an den Restriktionsenzymen interessiert ist, die das Molekül schneiden können, kann er alle anderen Visualisierungsoptionen deaktivieren.
  • Es ist auch möglich, nur bestimmte Funktionen ein- oder auszublenden.

10). Die Sequenzvisualisierung zeigt sehr detailliert, wie der DNA/RNA-Strang aufgebaut ist

  • Die lineare Ansicht liefert detailliertere Informationen, wie z. B. die tatsächliche Reihenfolge.
  • Fährt man mit dem Mauszeiger über ein Enzym, sieht man die Schnittflächen.

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