Casestudies Opstart

Snellere R&D en innovatie in veterinaire diagnostiek bij PathoSense

3 min lezen 29 mei 2024

"Werken met eLabNext heeft PathoSense in staat gesteld om R&D soepeler en sneller te laten verlopen. Dankzij de meerdere tools die worden aangeboden, is het nu mogelijk voor ons om vooruitgang te boeken richting innovatie zonder dat we ons zorgen hoeven te maken over waar cruciale informatie is opgeslagen, zoals SOP's, protocollen of aantekeningen van experimenten."

Adelaide Panattoni, R&D-wetenschapper en promovendus bij PathoSense

PathoSense

Diagnostiek in de diergeneeskunde kan een uitdaging zijn, maar PathoSense is een startup met een missie om dit te veranderen. Opgericht in 2020 als spin-out van het Laboratorium voor Virologie van de Faculteit Diergeneeskunde van de Universiteit Gent, heeft het bedrijf een platform ontwikkeld dat dierenartsen voorziet van de broodnodige volledige diagnostiek van infectieziekten.

Het platform is gebaseerd op nanopore sequencing van de derde generatie en omzeilt de belangrijkste diagnostische uitdagingen in de veterinaire diagnostiek; het vooraf selecteren van pathogenen voor analyse en het uitvoeren van een correcte monsterafname. Daarnaast levert het bedrijf ook sequencingdiensten voor bacteriën en virussen aan andere bedrijven en kennisinstellingen.

Doelen

Korte termijn: PathoSense streeft ernaar om haar klanten te voorzien van de meest up-to-date tools voor het analyseren van gegevens via haar constante onderzoek op het gebied van microbiome analyse, bacteriële en virale whole genome sequencing. Dit stelt zowel het bedrijf als zijn klanten in staat om voorop te lopen met innovatie op het gebied van veterinaire diagnostiek.

Op lange termijn: De PathoSense diagnostische test heeft al een revolutie teweeggebracht op het gebied van veterinaire diagnostiek door dierenartsen in staat te stellen om te screenen op ziekteverwekkers zonder voorafgaande selectie. In de toekomst wil PathoSense haar geavanceerde test uitbreiden door samenwerkingen aan te gaan met andere laboratoria in Europa. Hierdoor kan het bedrijf een betere monitoring van infectieziekten in de diergeneeskunde garanderen en snellere, nauwkeurigere behandelingen mogelijk maken. Daarnaast heeft PathoSense ook een sterke R&D focus om de constante verbetering van de aangeboden diensten te garanderen.

Uitdagingen

Voor de implementatie van eLabNext digitale lab oplossingen, had PathoSense het gevoel dat het ontbrak aan een georganiseerd systeem om experimenten bij te houden. Zowel routinematig werk als R&D experimenten waren slecht geannoteerd, vaak alleen in persoonlijke papieren notitieboekjes. Als gevolg daarvan was het moeilijk om de voortgang van het onderzoek te volgen en waren experimenten niet gemakkelijk repliceerbaar. Zonder een duidelijke en gestructureerde beschrijving van de experimenten was het moeilijk om bij te houden wat er onderhouden of aangepast moest worden. Dit resulteerde vaak in de noodzaak om met individuen te overleggen, wat extra tijd kostte.

Bovendien werden protocollen, samen met delen van experimentaantekeningen, opgeslagen in een gedeelde Google Drive-map. Dit vergemakkelijkte het bijhouden van documenten niet, waardoor het moeilijk was om de nieuwste versie van protocollen te vinden. Bijgevolg werden er soms fouten gemaakt door het gebruik van een niet-geoptimaliseerde versie van het protocol.

Tot slot werd het bijhouden van monsters georganiseerd aan de hand van een lijst op een blad, zonder de mogelijkheid om metagegevens toe te voegen of om snel de exacte locaties van monsters te identificeren, waardoor het proces omslachtig en ineffectief werd. 

Solution

Om een meer georganiseerd en gemakkelijk traceerbaar proces te creëren, besloot PathoSense om eLabNext's digitale lab oplossingen te implementeren, gebaseerd op de mogelijkheid van de software om experimenten, protocollen en monsters bij te houden in één platform. Het bedrijf koos voor de eLabJournal digitaal lab platform dat ELN (electronic notebook) en LIMS (laboratory information management system) combineert. Daarnaast heeft PathoSense ook de eLabInventory voorraadbeheer en eLabProtocols webgebaseerde beheerplatforms voor protocollen en SOP's. Er werd gehoopt dat de resulterende efficiëntie het bedrijf in staat zou stellen zich te concentreren op zijn onderzoek, waardoor groei mogelijk zou worden. 

Resultaten

De implementatie van eLabNext's digitale lab oplossingen bij PathoSense bleek zeer succesvol. Door het leveren van een gecentraliseerd platform om de R&D van het bedrijf te beheren, te volgen en te documenteren, speelde eLabNext een centrale rol in het groeiproces van het bedrijf als startup.

Eenvoudiger beheer van protocollen en SOP's

De invoering van eLabJournal en eLabProtocols bij PathoSense had een zeer positieve invloed op de manier waarop het bedrijf zijn protocollen en standaardwerkprocedures (SOP's) gebruikte en beheerde. Na de implementatie waren de protocollen altijd up-to-date en gemakkelijk te vinden voor alle betrokkenen, waardoor het bedrijf zowel tijd als geld bespaarde.

Toegankelijke experimentele gegevens

Een bijzonder hoogtepunt voor PathoSense was de experimentbrowserfunctie van eLabJournal. Met behulp van deze tool kan het bedrijf nu alle experimentinformatie tijdig en efficiënt opsporen. Dit heeft een enorm positief effect gehad op de voortgang van het bedrijf op het gebied van R&D en daarmee op de dienstverlening en veterinaire diagnostiek.

Georganiseerd bijhouden van monsters

eLabInventory bood een duidelijke, gemakkelijke en toegankelijke manier om zowel de locatie van monsters als de beschikbare opslagruimte voor nieuwe projecten bij te houden, wat een broodnodige oplossing was voor PathoSense. Dankzij de eenvoudig toegankelijke database met labinventarissen was het bedrijf in staat om de opslag van monsters radicaal te veranderen voor maximale efficiëntie en om het totale volume aan monsters aanzienlijk op te schalen.

Benieuwd wat onze oplossingen voor uw onderzoeksdoelen kunnen betekenen?

Neem contact op om meer te weten te komen!

Downloaden PDF

Aanbevolen Voor jou

3 min lezen 29 mei 2024

Snellere R&D en innovatie in veterinaire diagnostiek bij PathoSense

Ontdek hoe PathoSense veterinaire diagnostiek verbetert met eLabNext, processen stroomlijnt, gegevensbeheer verbetert en innovatie versnelt.

Lees meer
3 min lezen 01 mei 2024

Volledig geïntegreerd gegevensbeheer bij het Australische kinderkankerinstituut

Lees hoe eLabNext volledig geïntegreerd datamanagement mogelijk maakte voor het Children's Cancer Institute Australia.

Lees meer
3 min lezen 23 apr 2024

eLabNext zorgt voor meer georganiseerde en collaboratieve operaties voor GrittGene Therapeutics

Ontdek hoe eLabNext de laboratoriumactiviteiten van GrittGene Therapeutics heeft getransformeerd en de productiviteit en samenwerking heeft verbeterd.

Lees meer

Zet vandaag de eerste stap
naar een All Digital Lab!

Plan een persoonlijke demo voor deskundige begeleiding en een gratis evaluatie van uw labworkflow.

nl_NLNL